湛江市科学技术协会是中共湛江市委领导下的人民团体，处级建制。主要负责实施《中华人民共和国科学技术普及法》和《全民科学素质行动计划纲要》的综合协调等工作，负责指导开展日常性群众性科普工作；指导各市级自然科学、社会组织和各县（市、区）科协，积极实施创新驱动发展战略，开展学术交流、国际科技交流与合作、开展专题决策论证等。建立科技人才库及科技信息网、参与拟定科技政策法规等工作，广泛凝聚广大科技工作者为我市经济社会发展建言献策。
市科协机关内设3个部（室），办公室、学会学术工作部、科学技术知识普及部，还有湛江科技报社、湛江市科普中心两个科技直属事业单位。